Metagenom yoluyla yanlış anlaşılan enfeksiyonlardan hastalığa neden olan virüslerin saptanması

Editoryal Tıbbi Gerçekler/ Janine Budding 16 Mayıs 2023 – 23:35

Vücudumuzun hücreleri sadece kendi kalıtsal materyalimizi değil, aynı zamanda istila etmiş virüslerin de kalıtsal materyalini barındırır. Bu tam metagenomu analiz ederek bir virüs enfeksiyonunun nedenini belirlemek mümkündür. LUMC, Hollanda’da hasta bakımı bağlamında bu tür karmaşık analizleri gerçekleştiren bir uzmanlık laboratuvarına sahip olan ilk kuruluştur. Ellen Carbo tekniği daha da geliştirdi. Bu konuda doktorasını 17 Mayıs’ta alacak.

Ciddi enfeksiyonu olan hastalarda, yeterli tedaviyi başlatabilmek için suçluyu belirlemek önemlidir. Hastaneler, bunun bakteriyel mi yoksa viral bir enfeksiyon mu olduğunu belirlemek için standart testler kullanır. Ancak çoğu zaman asla bulunamadığı olur. LUMC’den Jutte de Vries, yeni virüsler de dahil olmak üzere tüm olası virüsleri bir kerede tespit edecek bir yöntem oluşturmak için tıbbi moleküler mikrobiyologlar ve biyoinformatikçilerle birlikte çalıştı. Tıbbi Mikrobiyoloji Bölümü’nde klinik virolog ve Leiden Üniversitesi Bulaşıcı Hastalıklar Merkezi’nde (LU-CID) doçenttir. Doktora adayı ve moleküler biyolog/biyoinformatikçi Ellen Carbo ile birlikte tekniği bunun için optimize etti ve hasta teşhisi için uygun hale getirdi.

Virüs algılama yazılımı

De Vries ve Carbo, örneğin klinik tabloya bağlı olarak kandan veya beyin omurilik sıvısından alınan hastaların metagenomunu kullanır. Dolayısıyla bu metagenom, yalnızca hastanın kendi genetik materyalinden değil, aynı zamanda birisinin beraberinde taşıdığı bakteri ve virüslerden de oluşur. Carbo: “DNA’nın nükleotid dizisini belirlediğimiz metagenom dizilişini bütün olarak yapmaya başlarsanız, mevcut virüsler hakkında tüm bilgileri de elde edebilirsiniz. Virüs tespiti için mevcut yazılımları kullanıyoruz. Bu, hasta örneğinden alınan DNA parçalarını bir araya getirir ve tüm insan ve hayvan virüslerinden oluşan bir veri tabanından hangi tür virüsün ona ait olduğunu gösterir. Yüksek konsantrasyonda, virüsün o anda güçlü bir şekilde çoğaldığını ve bu nedenle enfeksiyonun nedeni olabileceğini bilirsiniz.’ De Vries, tekniğin daha da rafine edildiğini ve daha hassas hale getirildiğini vurguluyor. `Yanlış negatiflere ve yanlış pozitiflere sahip olmak istemezsiniz. Test şimdi yüzde 90 ila 95 kesinlik sunuyor.’

Yurtiçi ve yurtdışından numuneler

Hastaneler artık LUMC’nin uzmanlık laboratuvarını nerede bulacaklarını biliyor. Hollanda ve yurt dışından hasta numuneleri, metagenomu incelemek ve yanlış anlaşılan bir enfeksiyon durumunda virüsü belirlemek için düzenli olarak Leiden’e gelir. De Vries, testin artık yalnızca bu durumlarda kullanıldığını söylüyor. “Teknik, teşhisin daha erken bir aşamasında uygulanamayacak kadar pahalı. Ancak daha ucuz hale gelir ve test daha da geliştirilirse – bunu LUMC’nin itici gücü olduğu Avrupa Klinik Viroloji Topluluğu içindeki bir sıralama ağı ile birlikte yapıyoruz – bunun gelecekte daha erişilebilir hale geleceğini hayal edebiliyorum. Bazen standart testler, hastaların birçok testten geçmesini gerektirir ve patojen asla bulunmaz. Testimiz, yeni virüsler hakkında da kesin bir yanıt sağlıyor.’

Kaynak: LUMC

Editoryal Tıbbi Gerçekler/ Janine Budding

Sağlık hizmeti sağlayıcıları için interaktif haberler konusunda uzmanlaştım, böylece sağlık hizmeti sağlayıcıları her gün kendilerini ilgilendirebilecek haberler hakkında bilgilendiriliyor. Her ikisi de özellikle sağlık hizmeti sağlayıcıları ve reçete yazanlar için haberler ve haberler. Sosyal Medya, Kadın Sağlığı, Hasta savunuculuğu, hasta güçlendirme, kişiselleştirilmiş tıp ve Bakım 2.0 ve sosyal alan benim için ekstra dikkat etmem gereken başlıklar.

Fizyoterapi ve Sağlık Hizmetleri işletmeciliği okudum. Ayrıca kayıtlı bir bağımsız müşteri destek çalışanı ve resmi olmayan bakım komisyoncusuyum. Ulusal ve uluslararası sağlık, sosyal alan ve tıp, ilaç endüstrisinde çeşitli pozisyonlarda çok fazla deneyimim var. Ve çoğu sağlık hizmeti uzmanlığı hakkında geniş tıbbi bilgiye sahip olun. Ve bakımın düzenlendiği ve finanse edildiği bakım kanunları. Her yıl bilgilerimi güncel tutmak ve en son gelişme ve yenilikleri takip etmek için Avrupa ve Amerika’daki önde gelen tıp konferanslarının çoğuna katılıyorum. Şu anda Uygulamalı Psikoloji alanında yüksek lisans yapıyorum.

Bu blogdaki gönderilerim, herhangi bir işverenin stratejisini, politikasını veya yönünü yansıtmadığı gibi, herhangi bir müşteri veya işveren tarafından veya onlar için çalışmıyor.

About admin

Check Also

Kumar oynayan çocuklarla bir anne olarak uğraşmak

Bir anne olarak farklı zorluklarla karşılaşıyorsunuz. Örneğin çocuklarınız bahis oynamaya başlayabilir. Çoğu zaman bu oldukça …

Bir yanıt yazın

E-posta adresiniz yayınlanmayacak. Gerekli alanlar * ile işaretlenmişlerdir